1、病蟲害少，可避免土壤連作障礙
無土栽培和園藝設施相結合，在相對封閉的環境條件下進行，在一定程度上避免了外界環境和土壤病原菌及害蟲對作物的侵襲，加之作物生長健壯，因此病蟲害的發生輕微，也較易控制不存在土壤種植中因施用有機糞尿而帶來的寄生蟲卵及重金屬、化學有害物等公害污染。
2、設施土壤栽培，常由于作物連作導致土壤中土傳病蟲害大量發生、鹽分積聚、養分失衡以及根系分泌物引起自毒作用等成為設施土壤栽培的難題，土壤處理和消毒不僅困難、成本可觀，而且缺乏高效藥品、消毒難以徹底，致使許設施土壤種植數年后，效益急速下滑，直至停種。
3、無土栽培可以從根本上避免和解決土壤連作障礙的問題，每收獲一茬作物之后，只要對栽培設施進行必要的清洗和消毒就可以馬上種植下一茬作物。
4、可極大地擴展農業生產空間：無土栽培使作物生產擺脫了土壤的約束，可極大擴展農業生產的可利用空間。
5、空閑的荒山、荒地、河灘、海島，甚至沙漠、弋壁灘都可采用無土栽培進行作物生產，特別在人口密集的城市，可利用樓頂涼臺、陽臺等空間栽培作物，同時改善了生存環境，在溫室等園藝設施內可發展多層立體栽培，充分利用空間、挖掘園藝設施的農業生產潛力。